《仁斋直指》序
卷之一 总论
五脏所主论
五脏病证虚实论
诸阴诸阳论
血营气卫论
脉病逆顺论
男女气血则一论
问病论
论《易简方论》
附：原脉论（出《保命集》）
附论五篇（出《丹溪心法》）
附：十二经脉歌
火湿分治论
虚实分治论
附：病机赋
卷之二 证治提纲
得病有因
治病当先救急
治病如操舟
用药中病不必尽剂
经常用药自有奇功
论肝脾生病
病人尺脉洪大
水气、肾气、血气、风毒擒纵治法
治痢要诀
简径治痢
姜茶治痢法
噤口痢
疟痢用常山、罂粟壳
治疟要诀
发疟呕吐勿用常山
疟有水有血
疟证寒热有根
常山治疟须用大黄为佐
寒热似疟
吐、汗、下治疟
疟后调理
退热
柴胡退热不及黄芩
退热有法
小儿风证解热有三
滞血发热
佐助小柴胡汤
肾热用五苓散
下后大肠热肿坠重
通利大便有法
饭后随即大便
脾泄、肾泄
肾泄
大便脱泄白脓
脱肛
小便不通
石淋
转胞
孕妇胎热似痢
下焦蓄血
产妇血块筑痛
身体血滞作痛
身体胸腹隐热、隐疼、拘急、足冷
血滞
血崩
吐血
治渴有法
酒家有病勿用温药
伤寒筋惕肉治法
发痉详证
胸胁痛引背上，头面两手浮肿
肚皮痛
胸膛气隔
附：证治赋
卷之三 诸风
风论
诸风证治
附：诸贤论
附诸方
附：预防中风出《干坤生意》
附：胃风
附：伤风
附：破伤风
寒
暑
湿
附：瘟疫
卷之四 风缓（附痿证）
风缓方论
风缓证治
附：痿证
历节风
附：痹证
脚气
卷之五
诸气（附梅核气、积聚、症瘕、痞块）